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基于Mfuzz算法进行高通量数据时间序列/基因表达模式聚类分析

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2023-10-27 15:22
[视频作者] Jingle进哥
[视频时长] 23:47
[视频类型] 校园学习
Mfuzz包最初是为处理基因表达或蛋白表达谱数据而开发的一种聚类方法,核心算法基于模糊c均值聚类(Fuzzy C-Means Clustering,FCM),用于在具有时间序列特征的转录组、蛋白质组数据中分析基因或蛋白表达的时间趋势,并将具有相似表达模式的基因或蛋白划分聚类,帮助了解这些生物学分子的动态模式以及与功能的联系。 本分享相关代码基于R包“ClusterGVis”(github:https://github.com/junjunlab/ClusterGVis), 由于此程序包的依赖项太多,在许多
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